Клиническими базами кафедры в разные годы были ЦГКБ: Городская клиническая больница №7 (ГКБ №7- Калкаман), Алматинская областная многопрофильная клиническая больница (АОМКБ), лечебно-диагностический центр (ЛДЦ). В настоящее время клинической базой кафедры является железно-дорожная много профильная больница. Преподаватели кафедры владеют полным объемом оперативных вмешательств. 3 сотрудников кафедры имеют высшую категорию, 2- первую категории.
Кафедра тесно сотрудничает с врачами базовых клиник. Ежегодно проводятся совместные научно-практические конференции по актуальным вопросам хирургии. Ежегодно кафедра инициирует организацию заседания общества хирургов г. Алматы и Алматинской области, проводит выездные циклы по различным вопросам клинической медицины и медицинского образования. К 80-летию вуза кафедра организовала и провела заседание общества хирургов г. Алматы и Алматинской области в феврале 2013г.; заседание Общества хирургов г. Алматы и Алматинской области (26.05.2015, г. Алматы). Доклад на тему: «Хирургическое лечение перитонита и профилактика его осложнений». Докладчик проф. Муканов М.У.
Заседание Общества хирургов г. Алматы и Алматинской области (26.05.2015, г. Алматы). Доклад на тему: «Современные возможности лечения и профилактики спаечной болезни брюшины». Докладчик доцент Маленкова С.А.
Научно-практическую конференцию «Современные аспекты лечения гнойных осложнений синдрома диабетической стопы». 21 декабря 2016 г. г. Алматы, ул. Масанчи 92, ФАО «ЖГМК – УКЦ». Докладчики: Рахматуллин Ю.Я., Салихова Т.А.
ДНИ УниверситетА – 2017. Научно-практическая конференция «Новые технологии в хирургии: современное состояние и перспективы развития». 18-19 мая 2017 г. Докладчики: Рахматуллин Ю.Я., Курамысов Е.А.
Кафедра провела День открытых дверей 04.05-05.05.2017г. в АМКБ и 04.05-05.05.2017 в ФАО «ЖГМК – УКЦ» .
Заседание Общества хирургов г. Алматы и Алматинской области (25.11.2017, г. Алматинская область, Уйгурский район).
Ко Дню Победы в Великой Отечественной войне кафедра ежегодно проводит бесплатный цикл консультаций в поликлинике ВОВ.