Научно-исследовательская работа на кафедре ведется по разным направлениям теоретической и практической фтизиатрии. Под руководством профессора Ракишевой А.С., совместно с НЦПТ РК выполнялась НТП  МЗ РК «Разработка мероприятий по профилактике туберкулеза с различными типами лекарственной устойчивости» (руководитель – профессор , в 2012 году — НИР по гранту  фонда Первого Президента РК «Студенты – группа риска заболевания туберкулезом». В 2013-2015 годах НИР выполнялись по внутривузовским грантам: «Разработка мероприятий по профилактике туберкулеза среди студентов», «Новые подходы к иммунотерапии с использованием надерина при социально-значимых заболеваниях, включая рак молочной железы, туберкулез, гепатит С» (совместно с кафедрами иммунологии, онкологии, инфекционных болезней), «Разработка алгоритмов ранней диагностики и прогнозирования течения менингитов различной этиологии населения города Алматы», в 2016 году  — ВВГ «Идентификация молекулярно – генетических прогностических критериев этнической предрасположенности к туберкулезу», совместно с кафедрой иммунологии. Под руководством академика Муминова Т.А выполняется грант Назарбаев университета, Центра наук о жизни совместно с Центром изучения глобального здоровья в Центральной Азии Колумбийского Университета  «Картирование эко-социальных и генетических факторов, определяющих восприимчивость к туберкулезу  населения Республики Казахстан»