Научная работа кафедры разнообразна. Основными темами являются:

• Современная диагностика и лечение хирургических заболеваний органов грудной и брюшной полости,
• Лечение социально-значимых заболеваний в хирургии,
• Внедрение инновационных методов в лечении хирургической инфекции и спаечной болезни.

      Ежегодно  преподаватели кафедры публикуют до 50  статей и тезисов, участвуют 3-х в 4-х конференциях различного уровня. В течении последних 5 лет сотрудниками кафедры получено 10 инновационных патентов.

За последние 13 лет на кафедре защищено 6 докторских и 12 кандидатских диссертаций.

В 2010 году на кафедре  завершенаи защищенадокторская диссертация.

В юбилейный год 2010 кафедра  провела Международную Конференцию «Актуальные вопросы гнойной хирургии» с выпуском сборника статей.

В 2012 г. кафедра провела конференцию «Новые технологии в хирургии для практического здравоохранения».

В 2013годукафедра провела конференцию «Новые технологии в хирургии и травматологии».

В 2014  году к80-летнему   Юбилею кафедры и 125- летию С.Д. Асфендиярова провели Международную научно-практическую конференцию «Современные тенденции в развитии хирургии».

в 2015году провели конференцию «Современные возможности профилактики и лечения спаечной болезни и острой спаечной кишечной непроходимости».

В 2016 году провели городскую научно-практическую конференцию «Современные аспекты лечения гнойных осложнений синдрома    диабетической стопы»